Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPEQ02224 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms