Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLCB3Q01970 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLCB3Q01970 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms