Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPCQ01831 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPCQ01831 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XPCQ01831 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XPCQ01831 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XPCQ01831 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
XPCQ01831 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
XPCQ01831 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
XPCQ01831 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms