Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAP1Q01518 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAP1Q01518 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms