Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MS4A2Q01362 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms