Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM2Q00987 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms