Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP1Q00587 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP1Q00587 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms