Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms