Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKOR1P84550 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKOR1P84550 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKOR1P84550 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKOR1P84550 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms