Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRX1P78414 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRX1P78414 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRX1P78414 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRX1P78414 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms