Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms