Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms