Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB10P61026 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB10P61026 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB10P61026 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB10P61026 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB10P61026 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB10P61026 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB10P61026 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms