Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX16P57768 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX16P57768 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX16P57768 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX16P57768 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX16P57768 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX16P57768 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX16P57768 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms