Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRLP54845 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRLP54845 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRLP54845 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRLP54845 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRLP54845 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRLP54845 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRLP54845 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRLP54845 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRLP54845 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRLP54845 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRLP54845 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRLP54845 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRLP54845 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms