Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP2S1P53680 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms