Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOSBP53539 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOSBP53539 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOSBP53539 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOSBP53539 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOSBP53539 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOSBP53539 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOSBP53539 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOSBP53539 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms