Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SMARCA4P51532 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA4P51532 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms