Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms