Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms