Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms