Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms