Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK8P49336 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK8P49336 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms