Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLD2P49005 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLD2P49005 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD2P49005 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD2P49005 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD2P49005 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD2P49005 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD2P49005 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD2P49005 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD2P49005 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms