Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204 ms