Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms