Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR4P46093 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR4P46093 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR4P46093 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPR4P46093 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPR4P46093 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR4P46093 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR4P46093 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR4P46093 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR4P46093 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR4P46093 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR4P46093 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR4P46093 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR4P46093 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms