Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRATP43155 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRATP43155 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRATP43155 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRATP43155 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRATP43155 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRATP43155 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms