Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL35P42766 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms