Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms