Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFC1P35251 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFC1P35251 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFC1P35251 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms