Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPC1P35052 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPC1P35052 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPC1P35052 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPC1P35052 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPC1P35052 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPC1P35052 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPC1P35052 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms