Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIITAP33076 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIITAP33076 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIITAP33076 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIITAP33076 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIITAP33076 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIITAP33076 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms