Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPOP30536 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPOP30536 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms