Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRABP1P29762 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms