Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms