Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GCSHP23434 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GCSHP23434 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCSHP23434 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GCSHP23434 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCSHP23434 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GCSHP23434 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GCSHP23434 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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