Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms