Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA1P20827 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms