Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL3P19876 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms