Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNNI3P19429 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNNI3P19429 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms