Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF1P10914 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF1P10914 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF1P10914 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF1P10914 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF1P10914 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF1P10914 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF1P10914 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF1P10914 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF1P10914 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF1P10914 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF1P10914 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms