Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-13P0DP09 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-13P0DP09 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms