Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L5P0DN76 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L5P0DN76 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L5P0DN76 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L5P0DN76 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
U2AF1L5P0DN76 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L5P0DN76 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms