Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APELAP0DMC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms