Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms