Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIL1P09327 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIL1P09327 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIL1P09327 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms