Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACAA1P09110 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms