Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms