Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA4P06727 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA4P06727 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA4P06727 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA4P06727 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms